这两种导弹在执行任务上也有区别，尹卓表示，弹道导弹都是作为战略武器使用，打击敌人的大中城市。在上世纪50年代有核武器之后，它就主要作为核武器的运载工具。也就是说，它可以打击敌人的大中城市，但是带的是常规弹头，在非核战争的情况下，用这些导弹可以打击敌人纵深的指挥所。
 
但是，巡航导弹打击精度比较高，美国第一批服役的巡航导弹，精度在30米以内。现在的巡航导弹精度一般都在10米以内，现在各国的巡航导弹，都能达到米级的精度。