遇害细节有三个版本
（1）说法一：被女子用湿布捂死
据马来西亚当地媒体报道，金正男2月6日抵达马来西亚，本来准备2月13日8时左右飞往澳门。当时他在机场准备登机，突然走来两名女子，其中一人将一块湿布捂在金正男脸上，之后迅速逃走。金正男随后向机场保安求助，但在送往医院的路上逝世。
（2）说法二：被女子用“毒针”袭击
有线电视网络TV朝鲜援引韩国政府内部消息称，现年46岁的金正男在马来西亚吉隆坡机场被两名身份不明的女性用“毒针”袭击。两名嫌疑人在杀害金正男后乘坐出租车逃走。马来西亚警方推测嫌疑人可能为女间谍。
（3）说法三：被女子用“毒布”袭击
据据马来西亚当地媒体报道，雪州总警长拿督阿都沙马指出，其中1名女子靠近金正男时，突然以一块沾有液体的布，捂著金正男的头脸，导致后者高喊眼睛火辣。“该名女子得手后立即逃走，金正男则通过机场柜檯人员协助，送往布城医院治疗，但于送院途中逝世。”
（4）金正男进入机场后并未通过移民检查处，而是在购物区倒下。
据朝鲜时报报道，金正男去世消息得到证实，其死亡将成为自2013年12月金正日的姑父张成泽被朝鲜当局处决以来最引人瞩目的事件。
