首先，牛奶是在小肠中通过乳糖酶分解的，这样乳糖才能分解成单糖，进入血液；而中国有三分之二以上的成年人小肠中缺乏乳糖酶，缺少乳糖酶的作用，乳糖就直接进入大肠，从而被大肠杆菌等细菌代谢、发酵、产酸产气，随后就会出现腹泻等不适症状。

其次，空腹喝牛奶之后，牛奶在胃肠道通过的时间加快，在胃内停留时间变短，排空时间变快，导致吸收效率降低。所以，喝牛奶时应配上固体食物，最好是配上主食，如面包、蛋糕、点心、饼干等。

牛奶中含有丰富的钙离子，茶叶中含有单宁酸，钙会与单宁酸反应产生不溶解的钙盐，会影响钙的吸收。

据统计，长期喝茶、饮用咖啡的人群，骨质疏松的概率相对要高一些，这可能与茶、咖啡影响钙吸收直接相关。

很多人认为高温消毒，但高温会使奶中的酪蛋白、乳清蛋白变性；其实，用60℃—70℃的开水冲奶粉，或者把牛奶加热到60℃—70℃是最合适的。

牛奶也不宜冷冻储存，因为冷冻会使牛奶中的蛋白质变性，脂肪分层；且解冻后，蛋白质和脂肪沉淀、凝固，既不利于人体吸收，也会使牛奶的价值大大降低。

牛奶里面的蛋白质会影响药物中的金属离子结合，影响一些金属离子在体内发挥作用。