秦王李世民发动政变，杀死了太子李建成和齐王李元吉，为了斩草除根，还杀光了他们所有的儿子，这就是著名血腥的玄武门之变。亲近李建成的大臣还会为太子喊冤，要皇帝主持公道。但是李渊能怎么办？惩办李世民？一来手里没有军权，二来现在只剩李世民一个儿子了。尽管当了太子，李世民的心里还是不安的，忠于李建成和李元吉的势力随时可能向他复仇，随时要求李渊为他们翻案。当了皇帝后这些都可以迎刃而解。
黯然神伤的时候，李渊可能有所后悔，太子与秦王有矛盾他一清二楚。他没有及时消除二人的隔阂，还乐于看自己的儿子相互争斗。内心里，他忌惮李世民的文治武功，又不想让李建成轻而易举地做接班人。所以，他一直在皇位上盘蹲不去，又不愿意站在公正的立场上居中调停。李世民感到严重的不安，李世民才铤而走险———李世民愿意摆出自己是迫不得已才这样的做的姿态，最后与自己的心腹们一起发起了玄武门之变。
李世民帐下心腹，拿着李建成和李元吉的头颅，去解除东宫力量抵抗的决心，当薛万彻等人看到太子李建成的血淋淋的脑袋，完全丧失了反抗李世民的动力，头儿都不在了，效力给谁看，还是赶紧树倒猢狲散，各自逃命吧。 李世民倒没有像嬴胡亥对待自己哥姐那样决绝，李建成和李元吉各自的女儿以及女眷基本都存活了下来，更有甚者，李元吉的王妃杨氏被李世民纳入宫中，这样的安排，想来也是李世民早就计划好了的。
