故事时间向前跳跃了两到三个月，失事飞机救援行动的细节要到9×02才会提及。由于许多角色另谋高就（离开Seattle Grace医院但是并没有离开该剧），所以今年至少会新增一所医院作为故事地点。Eric Dane将退出该剧，他的角色Mark只会演出两集。我们在花絮照中看到Mark躺在病床上昏迷不醒，那或许就是他的「结局」。此外，Meredith、Cristina和Derek都将安然度过空难（因为这三位演员成功续约），但Arizona（Jessica Capshaw）的命运仍是未知之数。
《实习医生格蕾第9季》剧情介绍第1集：
虽然Seattle Grace医院的医生们在本季首集中要面对上季坠机事件所带来的后果（特别是Lexie不幸遇难），但生活还要继续，他们必须调整心态去适应生活的巨大改变。缅怀逝者、事业、爱情，这三者并不矛盾，可问题是……他们能处理好这三者的关系吗？
《实习医生格蕾第9季》剧情介绍第2集：
本集将用大量的回忆镜头来描述上季结尾的坠机事件及过去几个月里幸存者的经历。与此同时，Seattle Grace医院的医生们苦中作乐，希望在混乱中找到一点安慰。
《实习医生格蕾第9季》剧情介绍第3集：
坠机事件的幸存者被迫做出一个可能影响余生的重要决定。与此同时，Jackson和April被迫一起工作，导致两人的关系持续紧张。Alex努力克制自己并远离一名实习医生。
《实习医生格蕾第9季》剧情介绍第4集：
Meredith意识到Derek可能再也无法拿手术刀了。为了不影响Derek的情绪，Meredith决定停止和他讨论工作中的事情——特别是她正在做的手术案例。与此同时，Richard找Catherine Avery医生协助他研究一个复杂的病例。Jackson和April的关系加速升温。Arizona仍然不肯正视自己的命运，Callie和Alex的负罪感也越来越强烈。
《实习医生格蕾第9季》剧情介绍第5集：
Meredith意识到Derek可能再也无法拿手术刀了。为了不影响Derek的情绪，Meredith决定停止和他讨论工作中的事情——特别是她正在做的手术案例。与此同时，Richard找Catherine Avery医生协助他研究一个复杂的病例。Jackson和April的关系加速升温。Arizona仍然不肯正视自己的命运，Callie和Alex的负罪感也越来越强烈。
《实习医生格蕾第9季》剧情介绍第6集：
空难的幸存者打算把针对航空公司的官司继续打下去，而他们也被迫面对身心伤害所造成的后果。与此同时，Bailey用小花招诱使Arizona帮助她解决一个儿科病例；Cristina希望融入新的环境——至少不要让自己感觉像个外人。
《实习医生格蕾第9季》剧情介绍第7集：
官司要打，但生活也要继续。对Cristina和Owen来说，理顺他们之间的关系是当前最重要的事情。Bailey和Ben在策划婚礼方案时为其中的细节起了争执。与此同时，Callie请求Jackson帮助她研究治疗Derek伤手的办法，但Jackson却面临自己的麻烦——他与April之间的新问题几乎占用了他的全部精力。
《实习医生格蕾第9季》剧情介绍第8集：
新来的实习医生们在Seattle Grace医院里卷入一系列戏剧性事件：Meredith要求Heather研究治疗Derek伤手的办法，但这实在超出了Heather的能力；Cristina鼓励Stephanie和Leah来一场友谊竞赛，却无心造成了一场医学危机；Alex和Jo共同挽救一个婴儿的性命，使Alex对Jo另眼相看；April给Shane上了很有价值的一课。
《实习医生格蕾第9季》剧情介绍第9集：
大家都在帮Bailey筹备婚礼，而Richard则帮助她缓解每一个新娘都要经历的「婚前紧张情绪」。与此同时，Lizzie与Meredith发生矛盾，Callie和Jackson试图劝说Derek参加一项风险很高的实验性手术。如果手术成功，他的伤手有望彻底复原。
《实习医生格蕾第9季》剧情介绍第10集：
为了挽救Adele的生命，Bailey决定推迟自己的婚礼；Cristina和Owen仍未对他们的离婚官司做出最后决定；Arizona和Callie试图找回昔日的激情；与此同时，一场可怕的事故导致多名摩托车手严重受伤，陆续抵达的伤员让Seattle Grace医院变得拥挤不堪。
《实习医生格蕾第9季》剧情介绍第11集：
坠机事件诉讼案有了新的进展，然而新的「大新闻」让Meredith、Derek、Cristina和Arizona四人震惊不已。与此同时，Richard竭力躲避Catherine的爱情攻势；Jackson接手Mark Sloane生前的一个病人；Derek开始进行手部康复治疗和训练。
《实习医生格蕾第9季》剧情介绍第12集：
一个新来的医学专家出现在医院里，所有人都感到好奇和紧张。Arizona产生幻肢感，身心痛苦让她倍感煎熬。怀孕和过分情绪化令Meredith不得不面对可怕的恐惧感。尽管空难幸存者每人得到了1500万美元巨额赔偿金，但却面临职业危机——「Seattle Grace」医院已处在破产的边缘。Alana Cahill医生在这个时候到医院来，就是为了帮助医院规避破产风险。
《实习医生格蕾第9季》剧情介绍第13集：
Derek和April争分夺秒寻找拯救医院的方法；一个快要死的病人的家属希望Cristina能尊重他们的意愿，但Cristina很难接受他们提出的要求；与此同时，Arizona必须面对一个和她一样有「身体缺陷」的病人。
《实习医生格蕾第9季》剧情介绍第14集：
卡希尔博士认为，一个上镜的医生对促成医院收购有利，亚历克斯和艾弗里都成为了，医院形象代言人的候选人。托丽斯和理查德担心医院被珀索西斯公司收购后，医院会被这群商人过于商业化，他们假扮情侣来到了这家公司收购的其他医院，事实验证了他们的担心。为了救治一个紧急病患，艾弗里等人私自暗中重开了ER，最终被卡希尔发现，这一行为，让卡希尔担心医院能否被顺利收购。托丽斯回来后，她召集了大家，提出了一个大胆的想法：他们应该把医院买下来。
《实习医生格蕾第9季》剧情介绍第15集：
由托丽斯牵头，飞机失事的受害者聚在一块讨论他们是否应该自己买下这家医院，德里克是他们中间的意见领袖，他认为他们应该买下来，而亚利桑那极力反对，这种会堵上不确定生活的计划。第二天，全医院都贴上了德里克的形象大使的海报，让德里克烦心不已。艾弗里和艾普丽尔的关系出现好转。而实习生在面对医院经历困难时，都在考虑自己的出路。最后，更具德里克律师的建议，飞机失事的受害者决定以全体的名义开一家公司，买下医院。
《实习医生格蕾第9季》剧情介绍第16集：
医院人心惶恐，连贝利医生都要另谋出路，飞机失事者们在德里克律师的帮助下，决定去寻找一个公司的投资，他们需要说服公司的CEO，他们具有管理能力，能够管好这家医院，后来他们找来了理查德帮忙，以说明他们的管理能力，可是他们组后还是失败了。Jo意识到，如果医院被收购，她将再也不能和亚历克斯工作，她回到医院，劝说实习生们。最后，艾弗里的母亲，为了让艾弗里和理查德不为了医院而伤心，决定投资买下医院，但前提是，艾弗里要成为医院的主任。
《实习医生格蕾第9季》剧情介绍第17集：
医院的新管理团队意见不合、矛盾重重，导致医院内部产生混乱（特别是意外得到权力的Avery尚不具备管理经验，而且他也不是很愿意待在这个位置上），又有一名「重量级」医生威胁要辞职不干。与此同时，医生和实习医生必须同时处理好几例器官移植手术——糟糕的是，每一例手术都遇到了独特的障碍。
《实习医生格蕾第9季》剧情介绍第18集：
为了重新塑造医院，新的董事会成员——飞机失事的受害者和杰克森在一起讨论，哪些医院该买下来。在大家的一致意见下，急救室又重新开始运营。一个能在13秒内做好全省X光的设备引起了大家的兴趣。贝利医生尽力去说服众人她的新的医学实验。亚利桑那和凯丽试图让她们的生活回到从前。艾普丽发现她想和马修发生关系却又无法弄清自己应不应该告诉马修，自己不是一个处女。格蕾和德里克发现他们即将有一个男孩诞生。在杰克森的提议下西雅图医院正式改名为格蕾-斯隆纪念医院。
《实习医生格蕾第9季》剧情介绍第19集：
在一起油罐车和越野车相撞的事故后，医院的病人已经超过了医院平时的接收能力。艾普丽接收了一个早产的病号，她还发现马修在爆炸中受伤。就在亚历克斯对乔的男朋友嫉妒的时候，乔和格蕾在诊断一个病例，一个男孩感染了链球菌，但是他的妈妈却认为他的孩子没事。亚利桑那尽力帮凯丽对TED的演讲放松。亨特与一个父母都在事故中受伤严重的男孩有亲密的接触，当男孩的母亲去世后,亨特想收养孩子，却没想男孩的父亲苏醒了。格蕾去找贝利医生，当她发现她不能为卓拉而奋斗的时候，同时她想让贝利医生查看她的基因图谱看是否有患老年痴呆症的基因。
《实习医生格蕾第9季》剧情介绍第20集：
为了防止自己患老年痴呆症后神志不清，格蕾让德里克修改了他们的遗嘱，并让杨同意在她出现症状之后，结束她的生命。艾普丽告诉了马修自己不是处女之间事情，马修因她的欺骗而愤怒，本来马修想让艾普丽见他的母亲一事也不了了之，艾普丽也因此大生艾弗里的气。亨特主任组织大家为医疗条件恶劣的叙利亚医生想办法做手术，大家通过努力，在物质缺乏的医疗条件下想出了多种的治疗方法。然而贝利却有了麻烦的事情，她的两个病人有术后感染症状，起初她以为是她的实习生的错误，因为她感冒了还对着病人打喷嚏，但是随着一个病人的死亡和第三例术后感染的病人出现，矛头指向了贝利医生。
《实习医生格蕾第9季》剧情介绍第21集：
疾病预防中心（CDC）的人来到医院调查传染的事，艾弗里因大家都倒向贝利医生而为医院的名声感到紧张。格蕾希望杨能够在她分娩的时候在分娩室里陪着她，一开始杨拒绝，因为她不想看到格蕾“poponthetable”，后来杨答应了。乔和亚历克斯因为亚历克斯告诉乔的男朋友乔的过去而吵架。韦伯医生为了平息感染事件的一个病人家属，告诉病人家属，CDC的调查时针对一个医生，而非整个医院。贝利医生偷听到了这番对话，感觉到韦伯是在针对她。当艾普丽在责怪艾弗里夺走自己的第一次的时候，马修意外的出现了，希望艾普丽能够再给他一次机会。杨发现自己在失去欧文，而卡莱夫发现自己爱上了乔。
《实习医生格蕾第9季》剧情介绍第22集：
CDC调查出来，贝利医生是无辜的，是源于劣质的手套造成，艾弗里也送了一口气，重新建立医院的秩序。然而贝利仍然对她的同事们十分生气，把自己锁在实验室里不肯出来，她一遍又一遍的测试自己的手上有没有带有链球菌，她感觉到自己很脏。亨特继续关组这那个男孩，而杨在尽力让男孩的父亲苏醒。亚利桑那在和劳伦合作，修复一名脸上长瘤子的男孩，之后两人在眉目传情，亚利桑那感到很纠结。卡莱夫离开医院的时候看到乔在和她男朋友打架，卡莱夫让乔离开他，但是乔还在生卡莱夫的气，不肯听从他的建议，结果在夜里乔的眼睛被打肿只好跑来卡莱夫家里避难。
《实习医生格蕾第9季》剧情介绍第23集：
天气预报说暴风雨将在三天后降临，医院开始紧急的准备物资和床位。卡莱夫依然用自己认为最好的办法来保护乔，他威胁了詹森，让他放弃找警察的念头。马修安排了一场壮观的求婚表演，艾普丽被突如其来的热情感动答应了马修的求婚。暴风雨比预料的来得快，医院断电了。就在这时候，格蕾即将生产。然而贝利医生还无法克服心里的障碍，只想躲在一堆文件工作后面，她让罗斯医生当她的帮手。就在这个夜晚，亚利桑那出轨了。
《实习医生格蕾第9季》剧情介绍第24集：
格蕾虽然顺利产下了婴儿，但是由于之前摔倒，出现了并发症，生命垂危，就在这时候，贝利医生克服了内心的障碍，在罗斯的协助下，为格蕾顺利完成了手术。一辆大货车就在急救室的门口翻车，大家都急忙的把车内的人救出来，就在车要爆炸的时候，艾弗里还在车里救一名小女孩，艾普丽大喊着艾弗里的名字，想要冲进去救他，这时众人才明白，艾普丽一直喜欢的是艾弗里。医院的电，迟迟无法恢复供应，婴儿的呼吸机都相继停止工作，医护人员只好稳定家长的情绪，将呼吸机换成手动呼吸。
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